Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf2Q64705 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms