Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2bQ64511 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms