Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprdQ64487 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprdQ64487 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprdQ64487 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprdQ64487 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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