Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms