Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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