Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a5Q63ZW6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms