Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sox19Q62249 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox19Q62249 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox19Q62249 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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