Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms