Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms