Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik5Q61626 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik5Q61626 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik5Q61626 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik5Q61626 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grik5Q61626 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik5Q61626 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik5Q61626 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms