Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim25Q61510 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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