Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms