Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mre11Q61216 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms