Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms