Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ncor1Q60974 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ncor1Q60974 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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