Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurod1Q60867 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms