Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms