Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CttnQ60598 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CttnQ60598 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms