Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms