Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms