Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms