Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnl1Q52KE7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnl1Q52KE7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms