Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms