Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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