Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc114Q3UX62 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms