Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms