Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chpf2Q3UU43 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms