Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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