Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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