Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms