Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms