Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms