Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hvcn1Q3U2S8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hvcn1Q3U2S8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hvcn1Q3U2S8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hvcn1Q3U2S8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hvcn1Q3U2S8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hvcn1Q3U2S8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hvcn1Q3U2S8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms