Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms