Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms