Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdlim7Q3TJD7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms