Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prr27Q3SYJ2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms