Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Specc1lQ2KN98 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Specc1lQ2KN98 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Specc1lQ2KN98 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms