Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms