Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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