Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms