Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd12Q0VE29 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms