Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms