Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms