Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnnm1Q0GA42 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms