Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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