Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdx4Q07424 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms