Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Siah2Q06986 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms