Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms