Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms